BG PLANTNET “Създаване на национална информационна мрежа генбанка – растителни генетични ресурси”

Проект по „Конкурс за финансиране на фундаментални научни изследвания – 2019 г.” към Фонд научни изследвания, Министерство на образованието и науката

Ръководител

доц. д-р Катя Узунджалиева от Институт по растителни генетични ресурси „Константин Малков” – Садово (ИРГР-ССА)

Стартова среща по проект към ФНИ

На 18.12.2019 г. в ИРГР Садово се проведе стартова среща по проект към ФНИ на тема: BG PLANTNET “СЪЗДАВАНЕ НА НАЦИОНАЛНА ИНФОРМАЦИОННА МРЕЖА ГЕНБАНКА – РАСТИТЕЛНИ ГЕНЕТИЧНИ РЕСУРСИ” с участието на представители на партньорските организации: Институт по растителни генетични ресурси „Константин Малков” – Садово (базова организация), Пловдивски Университет „Паисий Хилендарски” и Институт по информационни и комуникационни технологии (БАН). На срещата присъстваха също проф. д-р Виолета Божанова – зам. председател на ССА и д-р Живко Дучев – директор Дирекция „Информационно обслужване” към ССА и член на екипа от страна на ИРГР Садово. Събитието беше организирано от доц. д-р Катя Узунджалиева – ръководител на проекта. Обсъдена беше работната програма за първи етап на проекта. Участниците посетиха информационния център и генбанката за растителни генетични ресурси в Садово. Планирани бяха оперативни дейности и следваща среща на работните екипи.

Прочети повече

Работна среща по проект BG PLANTNET, финансиран от ФНИ

На 23.10.2020 г. в ИРГР Садово се проведе работна среща по проект BG PLANTNET “СЪЗДАВАНЕ НА НАЦИОНАЛНА ИНФОРМАЦИОННА МРЕЖА ГЕНБАНКА – РАСТИТЕЛНИ ГЕНЕТИЧНИ РЕСУРСИ”, финансиран от ФНИ. Събитието беше открито от доц. д-р Катя Узунджалиева – ръководител на проекта. доц. д-р Ася Стоянова, ръководител на екипа от ПУ „Паисий Хилендарски“, представи презентация на тема „Разработване на потребителски интерфейс – модул „Генбанка“ и първа версия на архитектурата на базата данни за документация на генофонда. Обсъдени бяха текущи въпроси, свързани с изграждането на структурата на базата данни за съхраняваните колекции растителни генетични ресурси. Работната среща се проведе при пълно спазване на всички противоепидемични мерки във връзка с ограничаване на разпространението на Ковид 19.

Прочети повече

Разпространение на резултатите от проекта на международна научна конференция в Букурещ, Румъния

През периода 02-04.06.2022 г. доц. д-р Николая Велчева от Институт по растителни генетични ресурси – Садово взе участие в Международна научна конференция „Agriculture for Life, Life for Agriculture”, организирана от Университет по агрономически науки и ветеринарнамедицина, гр. Букурещ, Румъния по проект BGPLANTNET. Представен беше доклад на тема:„Създаване на национална информационна система за растителни генетични ресурси вБългария” с авторски колектив: Николая Велчева (ИРГР), Катя Узунджалиева (ИРГР), АсяСтоянова-Дойчева (ПУ), Пенчо Малинов (ПУ).

Прочети повече

Техническа работна среща по проект BGPLANTNET “Създаване на национална информационна мрежа генбанка – Растителни генетични ресурси”

На 15.02.2023 г. в ИРГР-Садово се проведе работна среща по проект BGPLANTNET, Договор № КП-06Н36/2/13.12.2019 г. на ФНИ

Прочети повече

Участници

Институт по растителни генетични ресурси „К. Малков” – Садово (ИРГР-ССА):

доц. д-р Катя Узунджалиева – ръководител екип

проф. д-р инж. Мартин Банов

проф. д-р Тенчо Чолаков

доц. д-р Цветелина Стоилова

доц. д-р Гергана Дешева

гл. ас. д-р Николая Велчева

гл. ас. д-р София Петрова

гл. ас. д-р Евгения Вълчинова

гл. ас. д-р Николай Нейков

гл. ас. д-р Станислава Статева

гл. ас. д-р Албена Пенчева

ас. д-р Елисавета Василева

д-р Живко Дучев

д-р Божидар Кьосев

ас. Мария Петрова

ас. Иван Алексиев,

магистър Агр. Милена Николова

Пловдивски Университет „Паисий Хилендарски” (ПУ)

проф. д-р Ася Стоянова-Дойчева – Ръководител на екипа

проф. д-р Станимир Стоянов

доц. д-р Емил Дойчев

ас. докторант Пенчо Малинов

гл. ас. инж. докторант Александър Петров

ас. докторант Ирина Кръстева

докторант Себиха Маданска

докторант Даниел Русев

докторант Михаела Мишева

докторант Михаил Петров

Институтът по информационни и комуникационни технологии (ИИКТ-БАН)

проф. дн Любка Дуковска – Ръководител на екипа

доц. д-р Ирина Радева

доц. д-р Вера Ангелова-Димитрова

доц. д-р Вася Атанасова

доц. д-р Галя Илиева

проф. д-р Даниела Орозова

ас. докторант Стефан Койнов

ас. Станислав Дрангаджов

докторант Невена Моралийска

докторант Лидия Стойкова

докторант Христо Блидов

докторант Румен Кетипов

д-р Бистра Захариева

докторант Славяна Данаилова

докторант Красимир Марков

Анелия Дошева

Анотация

Опазването и целевото използване на растителния генофонд е национална отговорност и приоритет, успешната реализация на което е в пряка зависимост от добрата координация между всички изпълнители и заинтересовани страни. Институт по растителни генетични ресурси (ИРГР) е Национален координатор за страната в рамките на Европейската програма за растителни генетични ресурси (ECPGR). Научните направления се координират в съответствие с приоритетите на ЕК за земеделие и развитие на селските райони към ЕС. Растителният генофонд представлява публичен ресурс и в тази връзка информационните дейности са в основата на гарантирането на пълноправен достъп на всички заинтересовани страни. ИРГР поддържа специализиран електронен регистър PHYTO 2000 във формат Microsoft ACCESS 2003 за съхранените в генбанката семенни образци, която се нуждае от пълен реинженеринг, морално и технически остаряла, не отговаряща на изискванията на ECPGR и FAO. Цел на проекта е оптимизиране, повишаване на качеството и ефективността на съхранението и използването на РГР на национално ниво чрез изграждане на Национална информационна мрежа „Генбанка – растителни генетични ресурси” в съответствие с международните стандарти на FAO/Bioversity. Поставената цел изисква интердисциплинарност на проектното предложение като основната научна област – селскостопански науки е разширена с допълнителна научна област – математика и информатика.

В резултат от изпълнението на проекта ще се подобри значително работата на Националната генбанка за растителни генетични ресурси чрез гарантиране на функционалността и сигурността на документационната система и ще бъде гарантиран достъпа до растителния генофонд на всички заинтересовани потребители, съгласно подписаните от страната ни международни документи като Международния договор по РГР (ITPGRFA, 2009) и протокола от Нагоя, Япония (CBD, 2011). В създадената Национална информационна мрежа „Генбанка – растителни генетични ресурси” ще имат възможност да се включат всички институти, притежаващи колекции РГР в страната. Електронният портал за РГР ще доведе до висок научен и обществен ефект с функциите си да обслужва голям брой потребители на регионално, национално и международно ниво – учени, селекционери, земеделски производители (вкл. биопроизводители), НПО, екологични организации, студенти, ученици в сферата на аграрните науки и т. н., както и ще утвърди Националната генбанка на България, като генбанка, притежаваща една от най-богатите колекции РГР в Европа.

Работни пакети

За ефективно управление на реализацията на проекта и осигуряване постигане на проектните цели, основните дейности са групирани в следните шест работни пакета (РП):

РП1: Управление на проекта

1.1 Разработване на детайлна работна програма за етап 1

1.2 Изграждане на уеб сайт за работа и взаимодействие на екипа

1.3 Оперативно управление на проекта

РП2: Семантичен модел на РГР на България

2.1 Проучване на домейна за растителните генетични ресурси

2.2 Разработване на архитектура на онтологията за РГР

2.3 Реализация на онтологията за РГР

РП3: Система за сигурен достъп до генбанката

3.1 Изграждане на инфраструктура от физически и виртуални сървъри

3.2 Изграждане на приложения за комуникация между клиенти и блокова верига

3.3 Имплементация на частна блокова верига

РП4: Реинженеринг на генбанката

4.1 Проучване и анализ на наличните международни и национални стандарти и регламенти

4.2 Изграждане и реализация на архитектурата на новата структура на базата данни

4.3 Анализ и оценка на текущите данни и разширяване на архитектурата на базата данни

4.4 Създаване на автоматизиран подход за мигриране на текущите данни към новата архитектура

4.5 Въвеждане на информация не подлежаща на автоматизирана обработка

РП5: Потребителски интерфейс и интеграция

5.1 Създаване на модул централен регистър

5.2 Създаване на модул локален регистър

5.3 Създаване на модул за сигурност

РП6: Тестване, оценка, анализи при внедряването

6.1 Създаване на план за тестване

6.2 Тестване и оценка на онтологията за РГР

6.3 Тестване и оценка на блоковата верига

6.4 Тестване и оценка на потребителските интерфейси и интеграция

Публикации по проекта

Asya Stoyanova-Doycheva; Emil Doychev; Stanimir Stoyanov; Asya Toskova, An Intelligent Gene Bank Management System, 2020 International Conference Automatics and Informatics (ICAI), 1-3 Oct. 2020, Varna, Bulgaria, Article number 9311295, DOI: 10.1109/ICAI50593.2020.9311295,
https://ieeexplore.ieee.org/document/9311295/authors#authors
Stoyanova-Doycheva, A., Ivanova, V., Doychev, E., Spassova, K., Development of an Ontology in Plant Genetic Resources, 2020 IEEE 10th International Conference on Intelligent Systems, IS 2020 – Proceedings, 2020, pp. 246–251, ISBN: 978-172815456-5, DOI: 10.1109/IS48319.2020.9199935,
https://ieeexplore.ieee.org/document/9199935
https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=34880680500
Stoyanov, I., Stoyanova-Doycheva, A., Krasteva, I., Uhr, Z., A Personal Assistant Supporting Agriculture Operators, 2020 IEEE 10th International Conference on Intelligent Systems, IS 2020 – Proceedings, 2020, pp. 584–589, ISBN: 978-172815456-5, DOI: 10.1109/IS48319.2020.9199953,
https://ieeexplore.ieee.org/document/9199953
https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=34880680500
Asya Stoyanova-Doycheva, Nina Stancheva, Vanya Ivanova, and Stanimir Stoyanov, „Structure of an Ontology Used in a Test Generation Environment, AIP Conference Proceedings,Volume 2333,Issue 1, 8 March 2021, DOI: 10.1063/5.0042057, ISBN: 978-0-7354-4077-7
https://aip.scitation.org/doi/abs/10.1063/5.0042057
Krasteva, I., Glushkova, T., Moraliyska, N., Velcheva, N., A BLOCKCHAIN-BASED MODEL OF GENBANK STORE SYSTEM, 2020 IEEE 10th International Conference on Intelligent Systems (IS), Varna, Bulgaria, 2020, pp. 606-611,
https://doi.org/10.1109/IS48319.2020.9200133
Valkanov, Petrov M., Rusev D., Radeva I., Modelling Distributed Fault-Tolerant High Availability Storage Cluster Based on Block-Chain Concepts for Tracking Scientific-Research Progress, 2020 IEEE 10th International Conference on Intelligent Systems, IS 2020 – Proceedings, 2020, Article number 9199980, Pages 590-595, DOI: 10.1109/IS48319.2020.9199980,
https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85092747238&origin=resultslist
Doychev, P. Malinov, N. Velcheva, Z. Duchev, A Genbank Architecture, IEEE Conference on Intelligent Systems, IS’2020, Varna, Bulgaria, 26-28 August, 2020, Pages 580-583, ISBN: 978-172815456-5, DOI: 10.1109/IS48319.2020.9199972,
https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85092703531&origin=resultslist
Glushkova, T., Stoyanov, S., Popchev I., Doukovska, L., Ambient-Oriented Modelling in an Intelligent Agriculture Infrastructure, 2020 IEEE 10th International Conference on Intelligent Systems (IS), Varna, Bulgaria, 2020, pp. 612-618,
https://doi.org/10.1109/IS48319.2020.9199952
Velcheva N., K. Uzundzhalieva, S. Cheperigova. 2021. Information and documentation of Plant Genetic Resource`s Collections in Bulgaria. Международной научно-практической конференцией «Стратегия и приоритеты развития земледелия и селекции в Беларуси. Достижения науки – производству», 8-9 июля 2021 г., НАН Научно-практическом центре по земледелию, г. Жодино, Беларус, 307-313, ISBN 978- 985 - 880 - 142 – 7 https://izis.by/wp-content/uploads/IzdSbornik/2021
Velcheva N., Uzundzhalieva K., Stoyanova-Doycheva A., Malinov P. 2022. Establishment of National Information System of Plant Genetic Resources in Bulgaria. Scientific Papers. Series B. Horticulture. Vol. LXVI, No. 1, pp. 938-943, Print ISSN 2285-5653, CD-ROM ISSN 2285-5661, Online ISSN 2286-1580, ISSN-L 2285-5653. https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000888877000134?AlertId=fd419ea3-b756-4247-86ec-efce3f9d20c2&SID=EUW1ED0B79uX3CrHDvb6ja4kZ5UNT
Velcheva N., Uzundzhalieva K. 2022. Status of plant genetic resources for food and agriculture in Bulgaria: from genotype collecting to information access. Proceedings of IV. International agricultural, biological & life science conference AGBIOL, Edirne, Turkey, ISBN: 978-605-73041-3-1, рр. 178-187. https://agbiol.congress.gen.tr/files/site/16/files/AGBIOL%202022%20FULL%20PROCEEDINGS%20BOOK.pdf
Velcheva N. 2022. Preliminary survey for mapping the distribution of local varieties by using the national register of plant genetic resources in Bulgaria. Proceedings of IV. International agricultural, biological & life science conference AGBIOL, Edirne, Turkey, ISBN: 978-605-73041-3-1, рр. 442-448. https://agbiol.congress.gen.tr/files/site/16/files/AGBIOL%202022%20FULL%20PROCEEDINGS%20BOOK.pdf
Velcheva N., Stoyanova-Doycheva A., Cheperigova S. 2023. Data management and development of documentation system for Plant Genetic Resources in Bulgaria. Bulgarian Journal of Crop Science, 60(2), 26-32. https://cropscience-bg.org/page/en/details.php?article_id=1071